20 baki dua pihak telah berpecah kepada lima kumpulan empat. Cabutan untuk kumpulan telah mengambil tempat pada 22 Oktober 2008 di Zürich, Switzerland.[15]

Lima juara kumpulan akan layak ke Piala Dunia FIFA dan Piala Negara-Negara Afrika pada tahun 2010. Bersama-sama dengan mereka, lima naib juara dan lima pasukan tangga ketiga, layak ke Piala Negara-Negara Afrika.

Pengagihan

Pasukan diletakkan sebagai pilihan berdasarkan Kedudukan Dunia FIFA pada Oktober 2008 (nombor dalam kurungan) mereka.[16] Satu pasukan dari setiap bahagian berikut telah ditarik ke dalam setiap kumpulan.[17]

Kumpulan A

Kumpulan B

Kumpulan C

• Algeria dan Mesir selesai dengan rekod satu-lawan-satu dan keseluruhan yang sama. Algeria menang play-off pemecah seri 1 – 0 dan layak ke Piala Dunia FIFA 2010.

Kumpulan D

Kumpulan E